在浩瀚的二十四史中，能够被立传的医生并不多，扁鹊就是这为数不多的名医之一。司马迁在《史记》中有《扁鹊列传》，宣扬了这位神医的功绩。扁鹊的一生，留下了许多传奇故事，如为虢国太子治病，望齐候气色知病深浅，在有些历史记载和民间传说中，扁鹊堪称神医，无论什么疑难杂症他都能手到病除，最为神奇的就是说他能够透视人的五脏六腑，具有特异功能。
按照《史记》的记载，扁鹊姓秦，名越人，是渤海郡鄚人。鄚在战国时属赵国，汉置县，到了唐代改为莫，故城在今河北省任丘市鄚州镇。秦越人年轻时虚心好学，刻苦钻研医术。他把积累的医疗经验，用于平民百姓，周游列国，到各地行医，为民解除痛苦。由于秦越人医道高明，为百姓治好了许多疾病。他在赵国行医时，赵国人民送他“扁鹊”称号。扁鹊是一个“胸以上是人，胸以下是鸟”的神物，这是以鸟为图腾的赵国人把能够使他们逢凶化吉、转危为安的扁鹊视作福佑他们的神灵，因而，“鸟人合一”就成了赵人的图腾崇拜对象，扁鹊也就被神化为一个“人面鸟喙”的神物。另外传说黄帝时代有一个神医叫扁鹊，日本学者滕惟寅说：“扁鹊，上古神医也。周秦间凡称良医皆为之扁鹊，犹释氏呼良医为耆婆也，其人非一人也。”他把“扁鹊”作为神医的名号，只要是公认的神医都可以称之为扁鹊。
司马迁所说的“扁鹊”叫秦越人，少年时代曾在一家旅馆作领班，有一位在这家旅馆经常住宿的客人叫长桑君，非常喜欢这个年轻人，就把自己的医术传给了秦越人。秦越人行医以后治好了很多疑难大病，远近闻名，他的行医事迹及医学成就，可以反映出先秦时期的医药水平和医药特点，所以先秦有不少著作载有他的事迹。扁鹊看病行医提出了“六不治”原则：一是依仗权势，骄横跋扈的人不治；二是贪图钱财，不顾性命的人不治；三是暴饮暴食，饮食无常的人不治；四是病深不早求医的不治；五是身体虚弱不能服药的不治；六是相信巫术不相信医道的不治。反映出扁鹊的个性与特色。后来因为给秦武王治病，遭到秦王太医李醯的妒忌，最终派人杀死了扁鹊。以致司马迁感慨地说：“女无美恶，居宫见妒；士无贤不肖，入朝见疑。故扁鹊以其伎见殃，……故老子曰‘美好者不祥之器’，岂谓扁鹊等邪？”
相传中医经典著作《黄帝八十一难经》是秦越人所作，这本书以问答形式，共讨论了八十一个医学上的问题，故又称《八十一难》。其中一至二十一难讲脉学，二十二至二十九难讲经络，三十至四十七难讲脏腑，四十八至六十一难讲疾病，六十二至六十八难讲腧穴，六十九至八十一难讲针法。所以《难经》也是学习中医必读的经典之一，东汉名医张仲景在写《伤寒杂病论》时，就将《八十一难》作为重要参考书。但是经专家考证，《八十一难经》是在《黄帝内经》之后问世的作品，其著作年代应该是在汉代，不大可能是秦越人本人所写。也有人认为，《史记》说：“至今天下言脉者，由扁鹊也。”说明扁鹊的学术可以自成学派，而且传承很广。扁鹊有很多学生，如子阳、子豹等，医术都很高明，《难经》也可能是扁鹊弟子们整理的“扁鹊学派”著作，是对扁鹊学术的传承。
