台湾各界对"无国界记者组织"2009年报告，将台湾媒体自由度下降22名反应强烈。
"无国界记者组织"公布2009年全球媒体自由度报告，台湾的排名从前一年的36名，倒退到第59名
在还没有正式公布排名之前，台湾政府发言人-台湾新闻局局长苏俊宾就表示，他无法接受这个结果。
在野党-民进党的立法委员为此举行记者会说，"无国界记者组织"这次的报告证明国民党政府试图操纵媒体。
"干预媒体"
有些分析人士指出，台湾的公共电视基金会投书该组织，指称台湾的中央广播电台、中央社等等公营媒体在去年被施压，被迫改写新闻。
依照惯例，台湾公营媒体的领导层随政党轮替而更换，因此成了"政治立场相近者主掌公营媒体"。
分析人士说，这也导致"无国界记者组织"认为台湾的媒体不自由。
也有报道说，去年（2008年）11月，海基会和海协会在台北举行江陈会期间发生抗议事件，造成记者受伤，也是造成"无国界记者组织"将台湾媒体自由度排名降低的理由之一。
对有关政府施压，迫使公营媒体改写报道的指称，驻法国的台湾官员向BBC中文网表示，除了他们出面和该组织沟通之外，台湾总统马英九也曾经致函否认。
不过，从结果看来，似乎"无国界记者组织"并没有接受，而受访的台湾官员也对此表示无奈，只能表示会继续沟通。
整体情况
该组织的亚洲地区负责人-布罗塞尔则向BBC中文网表示，他们评分主要基于当地记者、记协回答的问卷，而且反映的是整体的媒体情况而不只是政府是否干预媒体。
布罗塞尔也不否认，记者本身的政治立场，也可能会影响评分。
他说，去年有记者采访台北江陈会而被抗议者殴打，此外大陆记者在台采访受到限制等等，都造成了台湾排名下滑。
布罗塞尔表示，名列前30的国家和地区，只要稍微有些影响记者权利的事件，很容易就会被排除到50名之外。
他还说，也不是该组织是否不接受马英九对影响媒体报道、干预媒体人事指称所做的否认，因为发生了如此的事件，自然就会影响排名。
布罗塞尔对大陆记者采访受限则表示，当初台湾为了不能在世卫组织作报道，曾经也抗议过，如今为了"国家安全"的理由设下限制，理由不够充分。
