西方自然科学其实是一个很不完备的东西，简单点说就是一个“大杂烩”。可能有人接受不了。大家想一想，是凡一个理论体系，比如西方的欧几里德几何学，就是一个典型的公理体系，它必须首先有一个或几个公理，如“两点之间直线最短”等，有了这个不证自明的公理为前提，再推演出其它定律，进而解决实际问题。而西方自然科学（以下简称科学）由很多科目组成，各科目之间相对独立，各大科目又分成许多子科目，而且这种分化越来越细，还产生许多所谓的交叉学科。这样就使得科学越来越失去一个总的公理标准，从而造成内部的混乱和不易把握。现在大家都知道，一个科学家穷其一生也不能研究透彻他所在的课题方向。有人说“简洁是才能的姊妹”，科学这种极端细化和日趋繁杂的趋势，是与自然界中简单、和谐之美相背道而驰的。
（1）数学
欧氏几何讲“两点之间直线最短”、“三角形内角和是180度”，一般人都会认为这是绝对真理了，可是在非欧几何（如黎曼几何）中，这些“基本”常识都被推翻，两点之间圆弧曲线最短。因为它所研究的空间体系与欧氏几何是不同的。在算术中，1+1=2可以说是公理了，但是我们也可以看到在有些情况下，1+1不是等于2。比如在高能物理中，一个正电子和一个负电子相遇就会发生“湮灭” 现象，化为能量，而不是两个电子。精子和卵子相遇则合为一个受精卵。有人可能就会说，1+1=2必须是两个同等性质的物体。也就是要加限定条件，前提条件不同了，结果也就不同了。
（2）“万有引力”
其实“万有引力”真是一个错误。很多人可能看到那个卫星和宇宙飞船在太空中飞的很好、很精确的按照预定轨道在走，就越发相信这个牛顿的“万有引力”。大家都传说，当年牛顿是受到苹果落地的启发才提出了“万有引力”，他也只是提出了这样一种假说，是根据前人总结出的天文观测数据。但他测不出那个所谓的引力恒量。直到一百多年后，卡文迪许设计了一个扭秤实验，才在金属小球之间测出了引力恒量，也才第一次测出了地球的质量。可是早就有人指出，这个扭秤实验只对厘米量级的小球作了实验，但实验条件过于苛刻，对其它形状、材质的物体是不是同样适用呢？就算其它情形也适用那个“万有引力”平方反比公式，也只是实际验证了厘米小球和太阳系内星体之间符合平方反比规律，但对于数米距离、数千克质量的物体之间的“万有引力”就无法证实其存在，更不用说测量了。既然不能得到广泛的实验验证，怎么能始终沿袭叫“万有引力”呢？叫“百有引力”也不对啊！
现代精确的实验装置证明，地球上某点的“重力加速度”在一天内随着时间会有微小变化，这似乎表明在一固定地点，物体所受的所谓“重力”不只是与其质量有关。这也是对传统引力理论的挑战。
在世界很多地方都发现了引力失常的区域，在那块地方，水是往上流的，斜坡上的球也会向上滚，如美国加州一个叫圣塔柯斯的小镇就有这么一个地方，你们不信可以上网去查。据说中国广东省中山市和珠海市之间就有一段公路是这样的。这些引力反常现象是推翻“万有引力”的突破口。
在宇宙学研究中，科学家做过测算，我们的银河系中所有星体之间若只有所谓的“万有引力”，是不足以维持银河系的存在的，星体会随着银河系自身的旋转而解体，因为没有足够的质量来相互吸引。科学家们为了自圆其说，只好提出了神秘的“暗物质”或“暗能量”的概念来弥补这种质量不足。这本身就说明“万有引力”在科学界也受到了严重挑战。还有近些年发现的宇宙加速膨胀，更是“万有引力”无法解释的。另外，前几年，美国航空航天局（NASA）报道先驱者10号、11号和尤利西斯号等航天器的运行轨道明显偏离根据“万有引力”计算出的轨道，他们说那些航天器受到了“神秘加速度”的牵引。我想这就是因为牛顿的“平方反比”假设对于太阳系以外的范围就不适用了。在理论物理学中，“万有引力”与其它重要的物理理论如量子场论等格格不入，也让理论物理学家们大伤脑筋。当然，还有爱因斯坦的广义相对论，我认为他只是提出了对引力的另一种描述方式而已。
当然，牛顿提出了引力假说，但却遇到了真正的难题：“第一推动力”问题，即太阳系内行星能够保持绕日近似圆周运动，就必须要有一个足够大的初速度，才不至于被吸到太阳上去。这个第一推动力确实难倒了大科学家牛顿，促使他晚年皈依神学，走入了宗教信仰。
