近年来，Linux在企业和政府部门中的应用越来越广泛，特别在亚洲地区，它已经给长期垄断市场的Windows操作系统带来了巨大威胁。
巴尔默在新加坡举行的微软亚洲政府领导人论坛上表示，Linux侵犯了至少228项专利，不过他并没有明确表示侵犯了哪些专利。他说：“对于那些已经加入世界贸易组织的国家而言，使用Linux就意味着有一天会有人过来向你收取专利费。”从某种程度上说，巴尔默的这一番话并危言耸听，今年年初SCO就曾经对多家使用Linux的公司提起诉讼。
新加坡国防部上个月在自己的2万台个人计算机都安装了开放源代码软件，取代了原来的微软操作系统。亚洲的其它几个国家正在开发自己的开放源代码软件，例如中日韩三国今年年初达成协议，将联合开发基于Linux的操作系统以取代微软的产品。其中，中国政府更是将对微软产品的依赖视为巨大的威胁，有安全专家认为微软操作系统中可能含有后门，一旦发生战争，美国政府就可以通过操作系统的后门进入中国网络，甚至造成网络瘫痪。
巴尔默表示，有些国家政府对于微软软件的担心完全是杞人忧天。他说：“我认为微软的软件要比开放源代码软件安全得多。我们的产品之所以安全主要是因为它背后有一家强大的公司提供支持，但谁也搞不清楚开放源代码软件是谁开发的。”
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