北京人士指出，香港政界出现“台独”踪影，给“一国两制”构成了严峻挑战，尤其是香港社会正处于转型时期，任何政治风波都有可能造成危乱。中央高层领导针对该事件明确指示要一查到底，应该重新整顿港岛政治秩序，严明制度管束。北京高层最近几次内部讲话，表示绝不允许香港成为分裂中国的基地。
处心积虑影响香港政治
在《基本法》实施之后，香港政治环境尚没有恶化到直接挑战国家主权尊严的地步，此番“台独”风波无疑是开了先河。北京担心如果这次风波没得到有效控制，台湾及香港的“台独”势力会进一步活动，香港会被台湾利用。北京人士认为，刘慧卿直接站到了“台独”一边，公然为“台独”分子张目，其所作所为，已经超出了现代民主政治的基本底线，触犯了中华人民共和国宪法和香港特别行政区《基本法》，应该引起包括香港市民在内的所有中国人的高度警惕。
依照中华人民共和国宪法，台湾是中华人民共和国的神圣领土的一部分。完成统一祖国的大业是全中国人民的神圣职责。作为中华人民共和国香港特别行政区的立法会议员，理应了解宪法的基本规定，理解中央政府对台湾问题的一贯立场，遵守宪法的规定，利用自己的社会影响宣传宪法。但是，刘慧卿显然在玩火，自己的前途暂不说，拿国家的前途在开玩笑，这其实也等于在出卖国家利益。
北京认为，刘慧卿在台湾的讲话，已不是言论自由的问题，因为她是香港立法会的议员，不是一般的人物。
北京人士认为，台湾岛上的“台独”势力对于香港社会实行“一国两制”历来持反对立场，目前香港与中国内地关系的日益紧密也给“台独”势力造成了心理威慑。因为，“台独”势力明白只要“一国两制”成功运行，两岸统一的可能性就存在，并且具备现实意义上的参照模式。当然，“台独”势力是不愿意看到这种局面出现的，只有想方设法干预香港政治生态环境的建设，从中培养内部力量演绎《特洛伊木马神话》，才能够达到影响整个香港政治倾向之目的。从另一方面看，北京一直不想香港成为一个政治城市，而只是一个经济城市，最近香港社会过分政治化使得北京非常担心。
北京人士指出，这次香港“台独”风波并不能简单看待，结合将要进行的台湾大选政情，事件的炮制似乎存在配合“台独”势力左右大选局势的嫌疑。
北京经过台湾的几次大选，已充分认识到每到选举之时，总有一些“台独”分子挑起事端，以所谓的族群分化和两岸分裂作为自己的政治主张，并以此达到激化矛盾，破坏共识的政治目的。而每次选举，台湾的“台独”势力都将北京拖入其中，以达到自己的目的。但是，台湾民众也并不全是拥护公投主张的，因为他们也害怕中国大陆的武力收复，也对“台独”主张的正确性心存疑问。所以，从自身利益出发，台湾民众的最终选择并不一定就是“台独”选择。
内地网站群起而攻
作为香港特别行政区立法会议员的刘慧卿，不从维护国家统一出发而积极宣传一国两制已经不对，相反她却是加入到“台独”行列中来诋毁国家统一，其言行必然遭到中港两地政治力量的谴责与排斥。刘慧卿在政治智慧方面的缺陷明显，也不适合生存于香港的政治圈中，因为即使香港政治界不处理她，中央政府也会出面平息。目前。中国大陆的网站进行的调查显示，刘慧卿已成为中国最令人讨厌的人。
北京人士强调，在二十叁条正式出台之前，刘慧卿的言论正在提醒香港社会，任何损害国家重大利益的言行都将被视为危险信号。香港社会的稳定在于人心，而不是国家机器的压力，顺应人心的二十叁条才可能受到香港社会的尊重。因此，高层制订二十叁条的用意要落实到维护港人切身利益上，在高度自治与中央支持之间放置一个平衡器，不能给“台独”势力以任何口实来攻击“一国两制”。香港社会的持续繁荣不仅是经济上的成功，也是政治民生状况的渐进改良，利用“一国两制”的成就来回应台湾民众将比“文攻武斗”更犀利，更见成效。
