犯罪電影大抵可分為兩類，一類是覺得「與己無關」，一類是「與己有關」。無論是否基於事實，前者會讓人感到有趣，具有娛樂性。但後者卻會讓人揪心、痛苦。《黑暗中的孩子們》是一部難以用平和的心態觀賞的影片。因為，片中的孩子和成人固然是虛構人物，但我們清楚地知道現實中這樣的事情確實在發生。雖然故事是虛構的，但該片卻擁有紀實片的震撼力。
本片講述，駐泰國的日本記者南部浩行（江口洋介飾）調查了日本心臟病患兒在泰國接受移植手術的內幕，他發現泰國兒童是被活生生地摘除了心臟。
在泰國社會福利機構工作的日本女子音羽（宮崎葵飾）發現被綁架的泰國兒童被迫賣淫的事實後，決心救出這些孩子。另外，南部為了揭露泰國兒童的生存現狀，和攝影師與田（妻夫木聰飾）一起對泰國兒童賣淫組織進行了追蹤。
有很多電影描寫的都是，對於警察都懶得管的事件，新聞記者和市民團體卻緊追不舍的故事。但是，電影《黑暗中的孩子們》之所以能如此震撼心靈就是因為，有意不讓故事情節充滿戲劇性地發展。現實生活中的新聞記者和市民團體成員在拍攝紀實片的過程中，往往會屢遭失敗和遭到某種威脅，該片就是這一現象的真實寫照。
影片揭露了私賣臟器的泰國犯罪組織的罪惡，也對不惜花費重金購買臟器的日本人進行了追蹤。這讓該片具有了更為強烈的震撼力，對購買者而言，無論採用何種方式也要買到臟器，否則他們就會失去孩子。影片沒有對臟器購買者進行譴責或辯護，導演把這一沈重的問題拋給了觀眾。
記者想告發私賣臟器的犯罪組織，來徹底改變現狀。市民團體職員則認為，拯救兒童才是當務之急。很難說誰才是正確的，這也是兩難的選擇。如片中台詞所說「這不是謊言，只是沒有人知道而已」，真相讓觀者揪心，恨不得不聽不看。
該片改編自旅日韓裔作家梁石日的小說。梁石日的小說《血與骨》以及同名電影曾轟動一時。《血與骨》描寫了一位上世紀20年代赴日的韓國男子狂躁、疲憊的人生。
從整體上講，片中演員的表演略顯生硬，對觀眾投入劇情有些影響。不過，妻夫木聰到位的演技反倒由此顯得更加出色了。最後疲軟的劇情反轉是畫蛇添足，有湊足時間的嫌疑。
