27日，日本農林水產省化驗結果確定，宮崎縣一家農場3,200隻雞死亡，是死於高致病的H5N1禽流感病毒。當局26日開始，全面撲殺、焚燒場內近50,000只家禽，至27日中午已撲殺21,000隻雞；並計畫再撲殺鄰近農場的50,000隻雞，以防止疫情擴散。
日本當局表示，目前所爆發的H5N1禽流感，病毒可能來自中國的候鳥。於是，農林水產省委託專家成立調查小組，針對爆發的H5N1型病毒進行基因排列分析，發現基因與前年在中國青海湖野鳥感染死亡的H5N1病毒，相似度達99%。
此外，南韓去年11月爆發的禽流感，也是由同一系統的病毒引起，專家推測病毒很可能是從中國北部往南飛的候鳥，把病毒帶至南韓和日本。
根據世界衛生組織資料，自2003年歲末以來，H5N1病毒已經感染了全球269人，造成163人死亡；由於感染或是防範而撲殺掉的雞，達數百萬至數千萬隻。
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