政黨輪替後，由於朝野關係長期緊張，對立嚴重，因此每年元旦府前升旗，在野黨都極少參與，國民黨也常常在其他地點另辦升旗典禮，與府方互別苗頭。
唯一的例外是二００四年元旦，當時的國民黨主席連戰與親民黨主席宋楚瑜在總統大選前，率同大批藍營立委走入凱達格蘭大道參與升旗典禮。
至於馬英九雖然多次參加府前升旗典禮，但都是以臺北市長身份率同市府官員參與，今年則是他首度以國民黨主席的身份參與升旗典禮。國民黨內預計包括各級黨務主管，以及黨內幹部、工作同仁，乃至於立委，到時參與者應不在少數，也是近年難得一見局面。
國民黨發言人黃玉振表示，元旦升旗典禮是國家儀典，也是全民的升旗典禮，因此馬英九以在野黨主席身份參與升旗，相當正常，沒有什麼特別之處。
國民黨目前打算，升旗典禮當天清晨先在舊中央黨部大樓前集合，再由馬英九領隊，一同走往總統府前凱達格蘭大道參與升旗。黃玉振說，國民黨到時打算和民眾站在一起，參與民眾升旗的行列，所以目前沒什麼特別的安排。
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