裝著軍事指揮系統 艙內擺設效仿家居
在這6年裡，「空軍一號」最遠也只到過金門、馬祖等幾個離島，一次也沒有飛出過臺灣「領空」。此次陳水扁決定坐「空軍一號」出訪一把南太平洋地區，是該機第一次「出遠門」。
737-800型飛機駕駛艙
陳水扁專機布局模擬圖
據臺灣媒體報導，為了躲避島內越來越高漲的「倒扁」浪潮，陳水扁已決定於9月初「出訪」南太平洋的「友邦」帕勞。與以往不同的是，這一次，「總統」寶座正受到威脅的陳水扁改變了向民間租用民航客機的習慣作法，破天荒地決定乘坐臺灣空軍的「空軍一號」專機出發。
臺灣「空軍一號」專機的正式名稱實際上應該叫做「臺總統府行政專機」。1998年，臺灣空軍以「為領導人配備‘行政專機’」的名義提出「空軍一號」採購案，經過臺灣「立法院」審查後，從臺國防部「國防機密」預算中劃出近7000萬美元巨資，向美國波音公司購買了一架波音737-800飛機。
2000年2月，臺空軍訂購的這架波音737客機飛抵臺北市松山空軍基地。飛機到手後，臺空軍做的第一件事情就是將飛機的外部塗裝改成了代表「藍天白雲」的藍白相間圖案，並在顯眼的位置漆上了「青天白日徽」以表明該機「尊貴」的身份。
可是時間到了今年5月，陳水扁突然要求臺空軍給「空軍一號」來個「大變臉」。也許是身處「綠營」對綠色極度偏愛的緣故，陳水扁要求將飛機的外表圖案設計成上部白色、中間黃色、底部綠色，而且綠色為飛機的主色調。據說，該圖案是陳水扁的「幸運色彩」。但臺灣媒體在看過之後卻嘲諷稱：「‘空軍一號’的新塗裝，怎麼看都像只‘青蛙’在天上飛。」
為了滿足陳水扁乘坐的需要，臺空軍花了數千萬美元的高價對該機的內部格局和電子設備進行了大幅改裝，並且在改造中處處模仿美國「空軍一號」專機的構造，不過，與之相比，臺灣的「空軍一號」只能算是小巫見大巫。
被臺空軍選為專機的737-800是波音系列客機中一種比較先進的型號，是波音公司在經典機型737的基礎上設計的新一代中程旅客機。從外觀上看，800型比其他737客機明顯長出一截，該機採用全經濟艙布局時可以搭載189名乘客。而作為陳水扁專機的這架737-800的全部座位共有116個，扣掉機組人員的6個座位，總計可以搭載110人。
臺灣「空軍一號」機身座艙分為3段，其中「總統座艙」設在機身前半部分，緊跟在位于飛機頭部的駕駛艙後面。「總統座艙」內部效仿家庭起居室的布局，設置有大床、茶几和4個寬大的座椅。臺空軍專機中隊原本打算安裝6個座椅，但考慮到扁夫人吳淑珍終日離不開輪椅，所以最後拆掉了兩個座椅，將「總統座艙」擴大為「無障礙活動空間」。
緊跟在「總統座艙」後面的是位於機身中部的「高官艙」，之所以這樣佈置，是為了方便「高官」們向陳水扁「匯報工作」。這個座艙的佈置一半與普通客機相同，是一排排的座位，另一半形似會議室。機尾部分則是隨從及幕僚人員乘坐的「隨員艙」，座艙布局與普通客機大同小異。
