東方日報報導，今次評估以理、工、農、管理四個門類中的數學、物理學、化學等十二個一級學科為對象。
評估依據自願參與原則，凡在十二個學科中有權頒授博士、碩士學位的院校都可申請參與。全國學位與研究生 育中心就各個參選單位有關學科的學術水平、學科建設水平進行評核，之後列出各個學科中的排名（見表）。在全國合資格參與的院校一千二百五十一家中，結果只有三百零九家參與評估。
全國理工科水準評估最佳大學
學 科 院 校
數學 北京大學
化學 北京大學
機械工程 清華大學
電子科學與技術 清華大學
信息與通信工程 清華大學
控制科學與工程 東北大學
計算機科學與技術 國防科技大學
生物醫學工程 浙江大學
作物學 華中農業大學
植物保護 中國農業大學
管理科學與工程 西安交通大學
物理 中國科學院物理研究所
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