至於政府高層一度考慮對目前疫情嚴重的萬華區採取高度管制類似「封區」作法，則因會對臺北市、縣交通衝擊過大，暫不實施，但將動員軍方加強消毒。
世界衛生組織昨天（10日）將臺北市由SARS中度感染區，提升為最嚴重的高度感染區。臺北防疫工作，更加刻不容緩。
為避免薩斯蔓延，臺北市針對大眾運輸交通實施新措施。從星期日（5月11日）起，搭乘捷運必須全程戴口罩，違反規定者將處新台幣1500元到7500元的罰款。
臺北捷運系統類似地鐵，部分路段在地下行駛，部分路段則在戶外行駛，但搭乘者都是處於密閉的車廂中，平均每天搭載人次達90多萬人。
面對SARS疫情，原本只是採取提供乘客「自願」量體溫的服務，如今疫情升溫，臺北市開始提升管制措施。
星期日各捷運車站的出入乘客大多能配合，戴上口罩。少數不符規定者，或接受勸離，或急忙去買口罩。
錄像監控
此外，疑似發生社區感染的萬華區華昌國宅，封街行動持續進行。
臺灣的內政部說，從星期一(5月12日)開始，對一些被懷疑執行隔離不好的家庭或個人，當局開始強行安裝錄像會議系統進行監控。這個系統可以傳送錄像和聲音，這樣更容易掌握被隔離者的行蹤，以防止疫情擴散。
由於萬華區內已先後有私立仁濟醫院、健安診所因發生院內感染而遭封院（最早因集體感染而遭封院的臺北市立和平醫院，雖屬於中正區，但也臨近萬華區），因此行政院長游錫堃考慮將萬華區列為「高強度管制區」，由軍警協助在萬華區各出入幹道設置檢疫站，採取「只出不入」原則，出來者必須量體溫、入內者不必量體溫。
這種類似「封區」的作法，臺北市長馬英九經評估後，認為不宜採行。（clip2）萬華區是連接臺北市與臺北縣的必經區域，臺北縣長蘇貞昌也認為一旦「封區」可能造成縣市交通癱瘓。
臺北市長馬英九星期日表示，萬華不會「封區」，而星期一（12日）開始的全市大掃除，會先從萬華開始，軍方將給予支援，預計出動化學兵1000人，憲兵700人。
感染升級
臺北市已被世界衛生組織（WHO）由SARS中度感染區，提升為最嚴重的高度感染區。根據臺灣衛生署星期日上午公布的疫情統計，全臺通報病例1099例，較前一日新增38例；其中，可能病例新增12例，達到184例；疑似病例新增11例，成為239例；死亡病例為18例。
但星期日下午臺北榮民總醫院宣布，院內治療的和平醫院護士林佳鈴病逝，使得死亡病例再添一人。這也是臺灣第三位因感染SARS死亡的醫護人員。
另外，臺灣有媒體報導指出，一名隸屬國防部警衛大隊，負責總統官邸守衛的張姓士官，被列入SARS可能病例，目前在家鄉苗栗的一家醫院隔離治療中。臺灣總統府官員表示，這位警衛人員負責官邸外圍安全勤務，與總統陳水扁並無工作接觸機會，不會影響總統健康，請各界放心。
